自然界是天然的化合物寶庫，動物或植物通過自身，產(chǎn)生了許多目前無法合成卻對 疾病有重大意義的化合物，因此動植物提取是獲取目標化合物的重要方式，也是生產(chǎn)原料藥的主要方式之一。例如的青蒿素和從動物內(nèi)臟中提取的的肝素等。近年來，通過從動植物組織中提取得到生產(chǎn)原料藥的高級中間體，再通過一定的化學合成和結(jié)構(gòu)優(yōu)化，最終得到目標化合物，這樣不僅能大幅度提高其 ，還能進一步減少其。例如 藥物喜樹堿通過進一步的結(jié)構(gòu)修飾，得到選擇性更好更小的鹽酸伊立替康、拓撲替康等藥物。
不少醫(yī)藥研發(fā)公司提供的藥品外包工藝服務，為在預定的工藝參數(shù)范圍內(nèi)運行的工藝能持續(xù)有效地生產(chǎn)出符合預定的規(guī)格標準和質(zhì)量的藥品提供了保障。在進行原料藥工藝研發(fā)與生產(chǎn)時，還要主要藥品生產(chǎn)質(zhì)量管理。藥品生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范以生產(chǎn)為基礎，有生產(chǎn)才有質(zhì)量。藥品的質(zhì)量是生產(chǎn)出來的，而不是檢驗出來的，生產(chǎn)管理藥依照GMP進行。